Em 2010, César foi eleito o melhor goleiro da Super Copa Eurofarma de Futebol Junior.
O goleiro foi titular no gol rubro-negro na disputa da Copa São Paulo Juniores, onde se consagrou campeão e foi eleito melhor goleiro da competição. Neste mesmo ano, César foi promovido ao time principal do Clube de Regatas Flamengo.
Em 2017 participou do segundo jogo da semifinal da Copa Sul-Americana contra o Junior Barranquilla, da Colômbia, onde se tornou herói para a torcida ao defender um pênalti nos últimos minutos da partida.
Em 18 de maio de 2018, César ampliou seu contrato com o Clube de Regatas Flamengo até abril de 2022.